爾時元始天尊諸大眾。在上陽官內敷演教法。
時有洞淵天尊上白元始天尊。竊見下界眾生民。盡染瘟疫之疾。四肢肚熱。手足酸疼。頭痛。眼華。五臟盛熱。迥如鍼刺。不能喫食。如何救療。
是時。元始天尊曰。皆是下界生民處居人世不敬三寶。呵天罵地。全無敬讓。心行諂曲。為非造罪。致令此疾所傷。凡為人民身強力健不知回向。出入往來並無避諱。蓋是五帝使者奉天符文牒。行於諸般之疾。凡人之所為係在簿書。遂行其毒。若人吸著。便成此疾。如有男子女人家染此患。宜令闔家斷絕五辛。低聲下氣。柔軟身心歡喜慈愍。禮謝辭遣。置立香位。請道迎具。於家建立道場。焚香轉誦妙經。依教禮謝開於道位。次施設齋。香燈如法。請於天符十二年。行病神王五帝使者。七十二侯聖者。二十四炁聖眾。行瘟大判官。俸藥主事。行豬羊牛馬瘟疫使者。祛災使者。癘毒使者。地分神王后土社令。各領部眾。俱降道場。大道之處解此毒癘。宜轉此經。一時禳謝。若凡人係在簿書。仍須勾銷。放赦奏聞。今有弟子某歸依投懇。拜奏誠心。莫為留難。改死重生。於是聖者見此禮謝收瘟攝毒故不流行。
是時。元始天尊乃為頌曰。
太上立科教。敬信除災殃。瘟疫留毒害。聞善化吉祥。
歸依念三寶。家門漸吉昌。若能轉此經。鬼禍悉潛藏。
是時洞淵天尊并諸大眾聞此聖言。各各歡喜作禮而退。信受奉行。
太上洞淵辭瘟咒神妙經 終
以下為 母娘所降之迴向文，可唸，可不唸。
恭請○○○（廟宇名）主神○○○○做主，
弟子/信女○○○恭誦 太上洞淵辭瘟神咒妙經 ○遍，
迴向給弟子/信女○○○的前世業障，
祈求○○○○○○○○。
殿主有話說：
恭請○○○（廟宇名）主神必須是你/妳經常去參拜廟宇的主神。比方說你/妳經常去台中市南天宮參拜，那麼你/妳就可恭請台中市南天宮的主神 關聖帝君做主，接收你/妳的願力。
唸經的地方必須是佛堂或神明廳，若是都沒有，只好退而求其次──客廳，若是住套房，那就只能在書桌前了。（記得書桌要整理乾淨喔！）
念經時務必雙手合什（合掌），如同持香，以示尊重！
念經的儀式中有三稱九叩首，若是在佛堂或神明廳，就得按照規矩來，一稱佛名（神明名）三叩首，如是者三次。若是在客廳或書桌前，合什（合掌）稽首三次，代替叩首。（心意非常重要。）